Detta projekt syftar till att beskriva metagenomen av perifytonsamhällen och koppla dessa till metagenomen av planktonsamhällen. Det är också kopplat till projektet "B-methylamino-L-alanine (BMAA) in natural environments" som delvis drivs av samma forskare.
Bakgrund
Mikroorganismer är viktiga för allt liv i Östersjön. De cyanobakterier (blågröna alger) som bildar de varje år återkommande “blomningarna” i Östersjöns ytvatten är viktiga primärproducenter av merparten av det kol och kväve som bygger upp djur och växtbestånden i Östersjön. Men samma cyanobakterier producerar även ett neurotoxin (BMAA) som återfunnits i djurplankton och fisk. Toxinet kan överföras till människan via föan och kan troligtvis förorsaka allvarliga sjukdomar såsom ALS, Alzheimers och Parkinsons.
Målsättning
Genom användandet av modern teknik, så kallad metagenomanalys och metatranskriptomik, kommer forskarna att kunna identifiera Östersjöns mikroorganismer på genetisk nivå med fokus på cyanobakterier. Syftet är att för första gången erhålla en helhetsbild av mikroorganismer i Östersjön, vilka de är, vad de gör och hur de gör det.
Projektet kommer att både kvantitativt och kvalitativt undersöka mikroorganismernas sammansättningar och aktiviteter, och utifrån det belysa deras mångfald och interaktion i Östersjöns ekosystem.
Beskrivning av arbetet på Askö:
Periphyton kommer att provtas genom att provtagare hängs ut. Dessa består av en bojsten på botten, rep, sänke, provtagare, och en boj/v äle. Efter 2.5 veckors koloniseringstid kommer biofilmen på provtagarna att skrapas av, centrifugeras och frysas i torris.
Växt och Miljövetenskap, Göteborgs universitet
Martin Eriksson,forskare, martin.eriksson@dpes.gu.se
Botaniska institutionen, Stockholms universitet
Birgitta Bergman, forskare, birgitta.bergman@botan.su.se
John Larsson, post doc, john.larsson@botan.su.se
Karolina Ininbergs, forskare, karolina.ininbergs@botan.su.se
Johannes Asplund, fältassistent, johannes_jtg@hotmail.com
Narin Celepli, fältassistent, narin.celepli@gmail.com
